Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXA3O43365 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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