Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MIS18AQ9NYP9 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MIS18AQ9NYP9 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms