Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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