Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TNIP3Q96KP6 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TNIP3Q96KP6 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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