Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ANKRD40Q6AI12 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD40Q6AI12 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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