Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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