Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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CDO1Q16878 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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CDO1Q16878 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CDO1Q16878 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CDO1Q16878 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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