Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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