Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms