Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNHIT3Q15649 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
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