Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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