Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SS18Q15532 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SS18Q15532 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SS18Q15532 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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SS18Q15532 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SS18Q15532 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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