Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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