Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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