Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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