Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RFTN1Q14699 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms