Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN5AQ14524 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.1 ms