Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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