Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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