Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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