Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms