Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms