Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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TCIRG1Q13488 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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