Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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