Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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ITGB3BPQ13352 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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ITGB3BPQ13352 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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ITGB3BPQ13352 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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ITGB3BPQ13352 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ITGB3BPQ13352 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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