Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATMQ13315 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms