Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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CHAF1BQ13112 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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