Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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