Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ACACAQ13085 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms