Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms