Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GRIN2AQ12879 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2AQ12879 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms