Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAB40BQ12829 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAB40BQ12829 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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