Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXO1Q12778 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXO1Q12778 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FOXO1Q12778 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXO1Q12778 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.8 ms