Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms