Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F1Q01094 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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