Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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