Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTIFO43310 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTIFO43310 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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