Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
J3KRW8 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
J3KRW8 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
J3KRW8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
J3KRW8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
J3KRW8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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