Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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VAX2Q9UIW0 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAX2Q9UIW0 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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