Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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USP29Q9HBJ7 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP29Q9HBJ7 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP29Q9HBJ7 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP29Q9HBJ7 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP29Q9HBJ7 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP29Q9HBJ7 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP29Q9HBJ7 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP29Q9HBJ7 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP29Q9HBJ7 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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