Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCBE1Q6UXH8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCBE1Q6UXH8 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCBE1Q6UXH8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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