| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.404-201 | ENST00000383978 | 102 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1297P-201 | ENST00000384415 | 104 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA12-201 | ENST00000391162 | 147 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR208B-201 | ENST00000401172 | 77 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-53P-201 | ENST00000410828 | 140 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SKP284-201 | ENST00000411002 | 343 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01549-201 | ENST00000440664 | 714 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP75-201 | ENST00000491601 | 451 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AF186996.7-201 | ENST00000492781 | 209 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC234781.5-201 | ENST00000508429 | 271 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02501-201 | ENST00000510420 | 426 nt | TSL 2 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008549.1-201 | ENST00000512900 | 643 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | APOOP3-201 | ENST00000536787 | 586 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093027.1-201 | ENST00000546698 | 429 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR5696-201 | ENST00000578474 | 85 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022035.1-201 | ENST00000579923 | 302 nt | TSL 2 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR5690-201 | ENST00000583739 | 73 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL158827.2-201 | ENST00000602494 | 330 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NCBP1-205 | ENST00000629069 | 249 nt | TSL 5 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL691447.3-201 | ENST00000635020 | 330 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PARPBP-201 | ENST00000327680 | 3014 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OSTN-201 | ENST00000339051 | 402 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-73P-201 | ENST00000363164 | 141 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-23P-201 | ENST00000363361 | 144 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-331P-201 | ENST00000384724 | 107 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA46.1-201 | ENST00000391069 | 153 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCYBP2-201 | ENST00000407745 | 171 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP201-201 | ENST00000410316 | 124 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-41P-201 | ENST00000410991 | 178 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL358453.1-201 | ENST00000422522 | 250 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL354949.1-201 | ENST00000446438 | 170 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP000705.1-201 | ENST00000454567 | 350 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC087477.1-201 | ENST00000465747 | 340 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ANXA2P1-201 | ENST00000505539 | 926 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP384-201 | ENST00000516615 | 116 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA48.11-201 | ENST00000517015 | 89 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HSPE1P18-201 | ENST00000517602 | 280 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP005436.2-201 | ENST00000528458 | 252 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CBX3P8-201 | ENST00000532412 | 525 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RAB11AP2-201 | ENST00000545905 | 639 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PWRN1-203 | ENST00000564898 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PWRN1-209 | ENST00000568019 | 359 nt | TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC098657.3-201 | ENST00000620434 | 263 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND4LP32-201 | ENST00000636111 | 270 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SACS-201 | ENST00000382292 | 15324 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RGS18-201 | ENST00000367460 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MAP3K2-203 | ENST00000409947 | 10992 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1188P-201 | ENST00000363795 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD114-30-201 | ENST00000364448 | 72 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-378P-201 | ENST00000384324 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA3.2-201 | ENST00000408221 | 125 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SUMO1P4-201 | ENST00000429430 | 302 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP50-201 | ENST00000434149 | 455 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | APOA2-205 | ENST00000468465 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02064-201 | ENST00000506492 | 470 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | VCAN-AS1-202 | ENST00000513899 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.675-201 | ENST00000516389 | 149 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC021269.2-201 | ENST00000532318 | 330 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02425-201 | ENST00000536217 | 376 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC084816.1-207 | ENST00000538317 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02293-201 | ENST00000548335 | 574 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | 7SK.7-201 | ENST00000603504 | 247 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PCGEM1.1-201 | ENST00000613431 | 131 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL591030.1-201 | ENST00000626131 | 627 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF280D-204 | ENST00000558320 | 3666 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYLC1-201 | ENST00000329312 | 2106 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TBC1D31-206 | ENST00000518805 | 2201 nt | TSL 2 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1159P-201 | ENST00000362933 | 107 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.259-201 | ENST00000364619 | 101 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA70B-201 | ENST00000384210 | 135 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR561-201 | ENST00000385216 | 97 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1093P-201 | ENST00000391194 | 107 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022028.1-201 | ENST00000412054 | 408 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGN2P35-201 | ENST00000412164 | 270 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007064.1-201 | ENST00000412238 | 351 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC243428.1-201 | ENST00000421099 | 264 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z82188.1-201 | ENST00000436709 | 154 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.632-201 | ENST00000459189 | 102 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC069133.1-201 | ENST00000522857 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003123.1-201 | ENST00000526041 | 333 nt | TSL 2 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC023442.3-201 | ENST00000532199 | 495 nt | TSL 2 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4795-201 | ENST00000584182 | 89 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL627309.6-201 | ENST00000606857 | 840 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCARNA4-201 | ENST00000629045 | 128 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.58-201 | ENST00000362807 | 102 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.154-201 | ENST00000363624 | 102 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U3.9-201 | ENST00000363823 | 204 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNY3P1-201 | ENST00000365085 | 102 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNY3-201 | ENST00000365484 | 102 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.490-201 | ENST00000384413 | 102 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-310P-201 | ENST00000384655 | 107 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.646-201 | ENST00000410980 | 101 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |