Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q1T7F1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q1T7F1 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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