Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CLPPQ16740 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms