Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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