Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ALX1Q15699 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ALX1Q15699 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ALX1Q15699 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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ALX1Q15699 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALX1Q15699 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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