Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGN3Q15651 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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