Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNHIT3Q15649 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms