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| CHD4 | Q14839 | AL713866.2-201 | ENST00000603579 | 219 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR6078-201 | ENST00000611069 | 100 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC024581.2-201 | ENST00000619986 | 252 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| CHD4 | Q14839 | C18orf54-201 | ENST00000300091 | 5237 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
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| CHD4 | Q14839 | RNU6-451P-201 | ENST00000362921 | 107 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| CHD4 | Q14839 | SIRPG-AS1-201 | ENST00000437384 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC012445.1-201 | ENST00000442831 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL139109.1-201 | ENST00000455491 | 297 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AL160287.1-202 | ENST00000638113 | 454 nt | TSL 5 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | MUC15-203 | ENST00000455601 | 3156 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZGRF1-203 | ENST00000445203 | 6529 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | CENPCP1-201 | ENST00000533085 | 2578 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-78P-201 | ENST00000362897 | 107 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-1090P-201 | ENST00000364065 | 94 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| CHD4 | Q14839 | TRDJ3-201 | ENST00000390476 | 59 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | PIGP-205 | ENST00000399103 | 656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6ATAC25P-201 | ENST00000408798 | 117 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC005062.1-207 | ENST00000418442 | 587 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AL583843.1-201 | ENST00000456070 | 346 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL160162.1-201 | ENST00000456715 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AP004607.1-201 | ENST00000524456 | 203 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC012493.3-201 | ENST00000604494 | 112 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | U6atac.1-201 | ENST00000616025 | 117 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-1317P-201 | ENST00000364582 | 104 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-1222P-201 | ENST00000384615 | 107 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | BTF3L4P2-201 | ENST00000392798 | 346 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC003092.1-201 | ENST00000415536 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPS15AP10-201 | ENST00000432472 | 382 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC092573.2-202 | ENST00000437243 | 336 nt | TSL 3 BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL22P13-201 | ENST00000493291 | 347 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC096733.1-201 | ENST00000503844 | 402 nt | TSL 3 BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU2-69P-201 | ENST00000516061 | 100 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | SNORA40.12-201 | ENST00000516329 | 111 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | BNIP3P6-201 | ENST00000549284 | 499 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC021231.3-201 | ENST00000558497 | 370 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC025678.1-201 | ENST00000567861 | 338 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL356157.2-201 | ENST00000605122 | 111 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | EDDM3A-201 | ENST00000326842 | 927 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-266P-201 | ENST00000364225 | 107 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU4-12P-201 | ENST00000365233 | 139 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC009480.1-201 | ENST00000402410 | 412 nt | TSL 3 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | PGBD4P6-201 | ENST00000421501 | 610 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL513185.2-201 | ENST00000425543 | 193 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL122017.1-201 | ENST00000435858 | 784 nt | TSL 2 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | MCHR2-AS1-203 | ENST00000451220 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL109763.1-201 | ENST00000455391 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU7-167P-201 | ENST00000459160 | 62 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL31P58-201 | ENST00000469001 | 379 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC100768.1-201 | ENST00000525512 | 506 nt | TSL 3 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR5000-201 | ENST00000577717 | 103 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | SNORA59B-202 | ENST00000578183 | 701 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR5692C1-201 | ENST00000585309 | 91 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC130469.1-201 | ENST00000597256 | 388 nt | TSL 5 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |