Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
SQLEQ14534 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SQLEQ14534 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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